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原核生物ゲノム解析用ツール ViGSAM

関塚産業 / 関塚産業
ID:K05132
カタログ (PDF) 解析プログラム購入申込書 (Excel)

次世代シークエンサーのショート・ロングリードデータから、シームレスな原核生物ゲノム配列解析をWindows、Mac、LinuxOSマシン上で解析可能です

ViGSAM

    専用のインストーラーにて各種オープンソースプログラムおよびデータベースのインストール・ダウンロードを自動で行い、専用プログラムを使用して解析を行う研究支援システムです。

  • シームレスな原核生物のゲノム配列解析
    過去の研究論文を参考に、一連の解析パイプラインを構築しました。
    解読リードのトリミング、de novoアセンブリ、contig配列のクオリティーチェック、生物種推定、遺伝子機能アノテーション、薬剤耐性遺伝子検出、病原遺伝子検出、プラスミドのInc type、MLST解析が一度に可能です。
    NGS解読リードもしくはfasta配列データをご準備頂き、解析リストを作成後にプログラムを起動することで、複数サンプルの解析が自動で実行できます。
    一部菌種では、血清型予測や各種タイピング解析も自動で行います。
  • 解析結果の概要をデータベース化
    解析後は、結果の概要をまとめた簡易的なデータベースを作成します。解析サンプルの確認・比較の際にご利用いただけます。

    • 【システム要件】
    最低スペック
    ・CPU：4core以上、メモリ：8GB以上、ディスク：500Gb以上
    ・Windows 11、macOS 12以上
    ・LinuxOSは、Ubuntu 22以上

仕様

シリーズ ViGSAM 初回・アカデミック版1年間使用ライセンス
（ダウンロード版/CD-R版）		 ViGSAM 更新・アカデミック版1年間使用ライセンス
（ダウンロード版/CD-R版）
詳細 ・PC1台に本解析プログラムを導入頂きます。
・ローカルマシンでご利用いただくライセンスです。
*当製品は、アカデミア限定となります。		・初回版1年間使用ライセンスご利用後のライセンスです。
・ローカルマシンでご利用いただくライセンスです。
*当製品は、アカデミア限定となります。
希望小売価格
（税抜）		 お問い合わせ
（CD-R版は、別途送料が追加されます。）		 お問い合わせ
（CD-R版は、別途送料が追加されます。）
*アカデミック対象ユーザは下記の通りです。
1. 大学、高専、高校等教育機関
2. 各省庁が認定している研究機関、医療機関
3. 国立研究開発法人、独立行政法人、大学共同利用機関法人、公益財団法人、地方公営企業（地方公共団体が経営する企業）
4. 特定非営利活動法人などのNPO団体
対象外となる機関であっても、エンドユーザー様が教育機関と兼任している場合はEmailアドレスまたは在職を証明する内容を提出頂ければアカデミック版の対象となります。
カタログ (PDF) 解析プログラム購入申込書 (Excel)
  • ※価格及び製品仕様は予告なく変更されることがあります。
  • ※価格に消費税は含まれておりません。
  • ※日本国内への販売に限らせていただきます。また、製品によっては、当社から直接販売ができない地域がございます。
  • ※会社名及び製品名は各社の商標または登録商標です。
  • ※製品の設置状況や付加機能を分かりやすく表現するため、製品に含まれない商品をあわせて掲載している場合があります。
  • ※表示金額以外に運送費、荷造費、搬入・据付費、組立設置費などを別途加算させていただくことがございます。
  • ※製品本来の使用目的に合わせてご利用ください。
  • ※製品によっては理化学実験の専門的な知識を必要とするものがあります。

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