クロマチン免疫沈降（Chromatin immunoprecipitation、略称 ChIP）は抗体を用いて特定のタンパク質に結合（相互作用）するDNA領域を回収する手法です。
クロマチン免疫沈降（ChIP）と、次世代シーケンスを組み合わせることによって、転写調節因子やクロマチン結合タンパク質とDNAの結合部位を解析することが可能です。
クロマチン免疫沈降により得られたChIP産物をシーケンスすることで得られたリード情報は、特定タンパク質の結合領域を指し示す配列情報の集合体です。リード情報をリファレンスに対してマッピングした場合、リードの集中する箇所が結合領域としてピーク状に検出されます。この領域情報、ピークコールなどの結果を納品します。
なお、タンパク質・DNAにより結合能やその力価が異なり ChIP条件（回収に最適な断片サイズなど）は一様ではないため、ChIP産物の回収まではお客様にて調製をお願いしております。ご了承ください。
実施可能なアプリケーション例
HiSeq2500, 50bp, single end,でシーケンスを行う場合には、6検体程度のサンプルをまとめてシーケンスすることが可能です。
NovaSeq6000, 150bp, paired end, 6Gb /sampleでシーケンスを行うことも可能です。こちらの場合は、サンプル単位でご依頼に対応をします。
＜代表的な仕様＞
ライブラリ調製：TruSeq ChIP Library Preparation Kit
シーケンス条件：HiSeq2500, 50bp, single end, 6検体/ 1lane
（シーケンス条件：NovaSeq6000, 150bp, paired end, 6Gb /sample）
データ解析 ：マッピング、ピークコール
