o8G、m7G、m6A、ψ、または m5Cを含む small RNA 修飾の検出および定量化を行うことが可能です。
| tRNA Modification Seq（m1A/m3C/m1G/m2,2G） | Small RNA Modification Microarray | tRNAのみに対応 | miRNA、pre-miRNA、tRNA、tsRNA（tRF および tiRNA）を含む複数の small RNA クラスに対応 |
|---|---|
| 修飾部位の一塩基分解能 アンチコドンや本体領域の特定塩基位置における tRNA修飾の重要な情報 | 小型 RNA における修飾部位を問わない修飾検出 |
| 複数のメチル化タイプ（m1A/m3C/m1G/m2,2G）の同時検出 通常、複数種類の修飾を受ける tRNA を対象 | プロジェクトごとに1種類の修飾 |
| Human Small RNA Modification Array V2.0 | |
|---|---|
| プローブ総数 | 14,706 |
| プローブデザイン | すべてのプローブは、5’キャップ断片、small RNA 特異的、および3’リンカー配列から構成されています。 |
| プローブの結合部位 | 5-p-miRNA および 5’tsRNA： small RNA の3’領域 3-p-miRNA および 3’tsRNA： small RNA の5’領域 pre-miRNA： pre-miRNA のループ領域 |
| プローブの特異性 | small RNA 特異的 |
| miRNA のカバレッジ | 2,627（1,318の 5-p-miRNA と 1,309の 3-p-miRNA） |
| Pre-miRNA のカバレッジ | 1,745 |
| tsRNAのカバレッジ | 4,254 |
| small RNA ソース | miRNA： miRBase（v22） pre-miRNA： miRBase（ｖ22） tRNA： GtRNADb（Updated to 18.1 2019.08）, ENSEMBL（v99） tsRNA： tRFdb, GtRNADb（Updated to 18.1 2019.08） Literatures： Scientific publications up to 2019［1-40］ |
| アレイフォーマット | 8x15K |
| Mouse Small RNA Modification Array V2.0 | |
|---|---|
| プローブ総数 | 14,895 |
| プローブデザイン | すべてのプローブは、5’キャップ断片、small RNA 特異的、および3’リンカー配列から構成されています。 |
| プローブの結合部位 | 5-p-miRNA および 5’tsRNA： small RNA の3’領域 3-p-miRNA および 3’tsRNA： small RNA の5’領域 tRNA：mature tRNA のアンチコドンループ配列 pre-miRNA： pre-miRNA のループ領域 |
| プローブの特異性 | small RNA 特異的 |
| miRNA のカバレッジ | 1,949（966 の 5-p-miRNA と 983 の 3-p-miRNA） |
| Pre-miRNA のカバレッジ | 1,122 |
| mature-tRNA のカバレッジ | 270 |
| tsRNAのカバレッジ | 1,767 |
| small RNA ソース | miRNA： miRBase（v22） pre-miRNA： miRBase（ｖ22） tRNA：GtRNADb（Updated to 18.1 2019.08）, ENSEMBL（v99） tsRNA： tRFdb, GtRNADb（Updated to 18.1 2019.08） Literatures： Scientific publications up to 2019［1-40］ |
| アレイフォーマット | 8x15K | Rat Small RNA Modification Array V2.0 |
| プローブ総数 | 14,895 |
| プローブデザイン | すべてのプローブは、5’キャップ断片、small RNA 特異的、および3’リンカー配列から構成されています。 |
| プローブの結合部位 | 5-p-miRNA および 5’tsRNA： small RNA の3’領域 3-p-miRNA および 3’tsRNA： small RNA の5’領域 tRNA：mature tRNA のアンチコドンループ配列 pre-miRNA： pre-miRNA のループ領域 |
| プローブの特異性 | small RNA 特異的 |
| miRNA のカバレッジ | 749（355の 5-p-miRNAと394の3-p-miRNA） |
| Pre-miRNA のカバレッジ | 448 |
| mature-tRNA のカバレッジ | 197 |
| tsRNAのカバレッジ | 1,135 |
| small RNA ソース | miRNA： miRBase（v22） pre-miRNA： miRBase（ｖ22） tRNA：GtRNADb（Updated to 18.1 2019.08）, ENSEMBL（v99） tsRNA： tRFdb, GtRNADb（Updated to 18.1 2019.08） Literatures： Scientific publications up to 2019［1-40］ |
| アレイフォーマット | 8x15K |
| 品質条件 | 詳細 |
|---|---|
| 対応生物種 | ヒト、マウス、ラット |
| サンプルタイプ | total RNA |
| 必要量 | 推奨量：＞10μg、最低量：＞5μg |
| 濃度（Nanodropに基づく） | 推奨＞100ng/μL、最低＞20ng/μL |
| 純度（Nanodropに基づく） | O.D.260/280： ＞1.7～2.1 O.D.260/230： ＞1.7～2.1 |
| RNA Integrity | ゲル電気泳動： 18S および 28S ｒRNA のバンドが確認でき、28S および 18S rRNA のバンド比が2:1程度であること。 BioAnalyzer： RIN＞7.0 ＊ 血清、血漿、エクソソームおよびFFPEなど、分解や断片化による品質低下がよく知られているサンプルに由来するRNAについては、解析結果の品質が低い可能性があります。お客様の同意があれば、ご提出いただいたサンプルで解析を行うことは可能ですが、データ品質が悪い、あるいはデータが取得できない可能性もあり、データ取得の保証はできませんので、予めご注意ください。 |
＊ DNase, RNaseフリーの1.5mLまたは2mLのチューブを使用してください。（スクリューキャップ式を推奨）
＊ ヌクレアーゼフリーの分子生物学グレードの水に溶解し、-80℃で保存してください。
＊ サンプルは、DNase処理を行うことを推奨いたします。
| サービス名 | 生物種 | 価格（税抜） | カタログ＃ |
|---|---|---|---|
| N6-メチルアデノシトシン（m6A）修飾 | |||
| Small RNA Modification Array （m6A）受託解析サービス |
ヒト | ￥268,000 | F-AS-RMH1-［サンプル数］ |
| マウス | ￥268,000 | F-AS-RMM1-［サンプル数］ | |
| ラット | ￥268,000 | F-AS-RMR1-［サンプル数］ | |
| 7-メチルグアノシン（m7G）修飾 | |||
| Small RNA Modification Array （m7G）受託解析サービス |
ヒト | ￥268,000 | F-AS-RMH2-［サンプル数］ |
| マウス | ￥268,000 | F-AS-RMM2-［サンプル数］ | |
| ラット | ￥268,000 | F-AS-RMR2-［サンプル数］ | |
| 8-オキソグアニン（o8G）修飾 | |||
| Small RNA Modification Array （o8G）受託解析サービス |
ヒト | ￥268,000 | F-AS-RMH3-［サンプル数］ |
| マウス | ￥268,000 | F-AS-RMM3-［サンプル数］ | |
| ラット | ￥268,000 | F-AS-RMR2-［サンプル数］ | |
| シュードウリジン（ψ）修飾 | |||
| Small RNA Modification Array （ψ）受託解析サービス |
ヒト | ￥268,000 | F-AS-RMH4-［サンプル数］ |
| マウス | ￥268,000 | F-AS-RMM4-［サンプル数］ | |
| ラット | ￥268,000 | F-AS-RMR4-［サンプル数］ | |
| 5-メチルシチジン（m5C）修飾 | |||
| Small RNA Modification Array （m5C）受託解析サービス |
ヒト | ￥268,000 | F-AS-RMH5-［サンプル数］ |
| マウス | ￥268,000 | F-AS-RMM5-［サンプル数］ | |
| ラット | ￥268,000 | F-AS-RMR5-［サンプル数］ | N1-メチルアデノシトシン（m1A）修飾 |
| Small RNA Modification Array （m1A）受託解析サービス |
ヒト | ￥268,000 | F-AS-RMH6-［サンプル数］ |
| マウス | ￥268,000 | F-AS-RMM6-［サンプル数］ | |
| ラット | ￥268,000 | F-AS-RMM6-［サンプル数］ | |
＊ 納期はお問い合わせください。
＊ この他、サンプルの海外輸送費が別途必要となります。
/
※お問い合わせは完了しておりません。
