DNAメチル化アレイ解析-illumina ID: J01801

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ゲノムワイドに1塩基レベルでのDNAメチル化定量ができます。

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サービスについて

特長

ゲノムワイドに1塩基レベルでのDNAメチル化定量ができます。
サンプル間比較結果を利用することにより、マーカーの絞り込みが可能です。

Human MethylationEPIC BeadChip
国際コンソーシアムのエキスパートが選定した85万以上のメチル化サイトをターゲットにしています。
FFPEを含む複数のサンプルを並行して分析することで、低コストかつ高スループットのデータを提供します。

CpGアイランド以外のCpG部位
ヒト幹細胞で見られる非CpGメチル化部位（CHH部位）
正常細胞との比較で腫瘍中に見られる差異的メチル化部位
FANTOM5エンハンサー
ENCODEオープンクロマチンおよびエンハンサー
DNase高感受性部位
miRNAプロモーター領域

Mouse Methylation BeadChip
専門家が選択した包括的カバレッジと高いサンプルスループットが独自の形で組み合わされており、ゲノムワイドDNAメチル化研究に最適です。
28万5,000箇所を超えるメチル化部位をヌクレオチド単位の解像度で調べることができます。

CpGアイランド、翻訳開始部位
エンハンサー
インプリント遺伝子座など

概要

送付して頂いたDNAサンプルの、クオリティチェック（QC）後、バイサルファイト処理を行い、Infiniumアッセイ・スキャンニング後、メチル化レベルの定量とサンプル間の比較解析を行います。
これらの作業は、CLIA/CAP認定を受けた弊社提携先のラボにて実施されます。

データ解析

Infinium MethylationEPIC BeadChipを用いてDNAメチル化の定量解析を行います。
GenomeStudioソフトウェアを用いてDNAメチル化レベルの定量を実施します。
全サンプル・全マーカーのDNAメチル化レベルの定量、検体間(群間)比較、DNAメチル化レベルの差が大きいマーカーについてクラスタリングとヒートマップ作成をします。

納品物

データディスク: メチル化定量データ（txtファイル）
グループ間比較解析データ（txtファイル）
クラスタリング解析データ（bmp画像ファイル）

サンプルについて

マイクロアレイフォーマット	ゲノムDNA量	サンプル濃度(ng/μL)	OD260 /280	性状
Infinium MethylationEPIC BeadChip（＊1）	2,000ng以上	50ng/μL以上	1.8～2.0	⊿Ct≦5（＊2）

＊1 バイサルファイト処理済みのサンプルも受入れ可能です（サンプルの品質評価は実施しません）。
　　ZYMO RESERCH社 EZ DNA Methylation KitまたはEZ DNA Methylation-Goldを推奨
＊2 FFPE由来DNAのCt値からコントロールDNAの平均Ct値を引いた値。

・サンプル量が上記に満たない場合はお気軽にご相談ください。
・組織、細胞等は、DNA/RNA抽出をご確認いただくか別途お問い合わせください。
・送付方法はサンプル送付方法をご確認ください。

ご注文に関して

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目	価格（税抜）	納期
DNAメチル化アレイ解析-illumina	お問い合わせ	サンプルのクオリティチェック（QC）通過後、1.5～2ヶ月程度

受託オンラインCommissioned Research Online株式会社薬研社 株式会社薬研社