マクロジェン・ジャパン / コスモ・バイオ ID: J00527

マイクロアレイ受託解析サービス:microRNA 発現解析 ID: J00527

サービスについて

概要

AgilentおよびAffimetrixのマイクロアレイを用いたmiRNA発現解析サービスを提供します。Chipは、最新のmiRBaseを基に、随時更新されています。微小胞やFFPEサンプル、血清など様々なサンプルで対応可能です。また、Target mRNAのアノテーションなど、様々な統計的サービスも提供します。

各社アレイの特長

  Agilent affimetrix
対応可能な種 Human、Mouse、Rat及びカスタムチップ 様々な種でご用意しています。
各 miRNA の反復数 20 replicates 9 replicates
特長 ・最新のmiRBaseに対応
・miRBaseにあるすべてのコンテンツでカスタマイズが可能
・miRNA検出、特にqPCR、シーケンシング、その他マイクロアレイのプラットフォームで優れた一貫性
・高い再現性(0.95/inter and intra-lot)
・高感度:130ngのトータルRNAから得られる1.3amolのmiRNA転写産物の80%を検出

解析内容

  • miRNA発現量比較解析(fig.1
    ・標準的な統計解析(Fold change、群平均、SD等)
    ・異なる発現遺伝子の同定(T-test、LPE test、ANOVA等)
    ・多重検定補正(FDR、Bonferroni等)
    ・発現変動miRNAのクラスタリング分析 (階層的クラスタリング、k-平均法等)
  • 標的mRNA分析
    ・miRDBによる予想される標的RNAのアノテーション
    ・miRBaseによるmiRNAの解説
  • カスタム解析(fig.2
    ・統合解析 (mRNA-miRNA、methylation-mRNA、mRNA-CNV 等)

ご送付いただくRNAのQC基準

アプリケーション プラット
フォーム
サンプルタイプ 純度(A260/280)      純度(A260/230)      濃度(ng/uL)    総量(ug)  rRNA比   RIN   その他  
mRNA Expression Agilent GeneExpression トータルRNA >1.5 >1.0 >70ng/uL >0.1 ug >1.0 >7.0 without DNA  
contamination
without
Trizol contamination 
Affymetrix GeneExpression >34ng/uL
miRNA Expression Agilent miRNA トータルRNA >1.5 >1.0 >50ng/uL >0.1 ug >1.0 >7.0 Vsible small RNA peak
Affymetrix miRNA トータルRNA または スモールRNA >17ng/uL >0.13 ug

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

* 解析を含まないサービスのご注文の際は、品番末尾に「W」を入れて下さい(例: MAG-0009W)

プラットフォーム 最低注文サンプル数 希望販売価格 品番*
解析含む 解析含まない
Agilent miRNA Human SurePrint miRNA Microarrays 8 x 60k 8 ¥613,000 ¥587,000 MAG-0009H
Mouse SurePrint miRNA Microarrays 8 x 60k 8 ¥613,000 ¥587,000 MAG-0009M
Rat miRNA Microarrays 8 x 15k 8 ¥620,000 ¥594,000 MAG-0009R
Affymetrix miRNA 203 organisms miRNA 4.0 Array 1 ¥121,000 ¥117,000 MAG-0105

* 繁忙期にチップの在庫がない場合は上記よりも長く納期がかかります。

関連サイト