Agilent | affimetrix | |
対応可能な種 | Human、Mouse、Rat及びカスタムチップ | 様々な種でご用意しています。 |
各 miRNA の反復数 | 20 replicates | 9 replicates |
特長 |
・最新のmiRBaseに対応 ・miRBaseにあるすべてのコンテンツでカスタマイズが可能 ・miRNA検出、特にqPCR、シーケンシング、その他マイクロアレイのプラットフォームで優れた一貫性 |
・高い再現性(0.95/inter and intra-lot) ・高感度:130ngのトータルRNAから得られる1.3amolのmiRNA転写産物の80%を検出 |
解析内容
- miRNA発現量比較解析(fig.1)
・標準的な統計解析(Fold change、群平均、SD等)
・異なる発現遺伝子の同定(T-test、LPE test、ANOVA等)
・多重検定補正(FDR、Bonferroni等)
・発現変動miRNAのクラスタリング分析 (階層的クラスタリング、k-平均法等) - 標的mRNA分析
・miRDBによる予想される標的RNAのアノテーション
・miRBaseによるmiRNAの解説 - カスタム解析(fig.2)
・統合解析 (mRNA-miRNA、methylation-mRNA、mRNA-CNV 等)