Cellecta / コスモ・バイオ ID: J00533

ハイスループットCRISPR-Cas9 遺伝子スクリーニング受託サービス ID: J00533

スクリーニング後の次世代シーケンシング作業と解析、承ります!

サービスについて

サービス概要

Cellecta社が提供するsgRNAライブラリーや、非営利研究機関へ提供されているGeCKOライブラリーといった、プール型レンチウイルスCRISPRライブラリーを利用したスクリーニング実験の「次世代シーケンス」と「データ解析」をご提供しています。
Cellecta社のsgRNAライブラリーやGeckoライブラリーを使用して、各培養時間または処理条件(1サンプル)で回収した細胞をそのままご提供頂き、Cellecta社にてDNA抽出、増幅、配列決定、およびデータアセンブリと基本的なデータ解析を行います。

受託サービスの流れ

本サービスは、CLT社あるいは、GeCKOライブラリーを使用して調製した各サンプルの凍結ペレット(細胞・組織)をご提供いただき、CLT社にてDNA抽出・増幅、次世代シークエンシングデータ取得・解析を行い、sgRNAおよびその標的遺伝子のリストをご提供するものです。サンプルは、フェノール-クロロホルム耐性の15mLサイズのポリプロピレン遠心用チューブに保管し、黒色または青色のアルコール耐性マーカーで各チューブにサンプル名をご記入いただき、チューブラベルとサンプル詳細とを記載したリストと共にドライアイス便でご発送ください。

1. お申込書類記載
2. CLT社へ細胞・組織ペレット(またはゲノムDNA)の送付
3. CLT社にて実験・解析作業
  1. 各サンプルからゲノムDNA抽出する(細胞、組織ペレットの場合)
  2. 抽出したゲノムDNAのgRNA配列あるいはバーコード配列を増幅後、ハイスループットシークエンシング用に調製する
  3. Illumina社NextSeqまたはHiSeqによる次世代シークエンシング(NGS)作業の実施
  4. シークエンシング生データからsgRNA数をカウント
    (ア)各sgRNA配列の相対存在量の算出
    (イ)サンプル間の差異計算(お客様より何れのサンプル間を比較するという情報をいただいた場合に限ります)
  5. 報告書を作成
4. コスモ・バイオより報告書(電子データ)を納品

ご注文に関して

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参考価格・納期

サービス項目 品番 価格(税抜) 納期
Barcode NGS of DNA from Genetic Screen,
>100M Reads (screening done with Cellecta Library)
CANA-100SQD お問い合わせ お問い合わせ
DNA isolation from Cell peletts for Sequencing CANA-DNA お問い合わせ お問い合わせ
DNA Isolation from Tissues for Sequencing CANA-DNAT お問い合わせ お問い合わせ
NGS of DNA from Genetic Screen
(screening done with Cellecta or GeCKO Library)
CANA-SQD お問い合わせ お問い合わせ
NGS of DNA from Genetic Screen
(screening done with Cellecta or GeCKO Library), Academic
CANA-SQD-A お問い合わせ お問い合わせ

* 15サンプル以上からディスカウントがございます。詳細はお問い合わせください。

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