Cellecta / コスモ・バイオ ID: J00534

CRISPR ヒト/マウスゲノムワイド sgRNA ライブラリ ID: J00534

印刷

低コストでゲノムワイドな遺伝子探索を実現！！

カテゴリ

サービスについて

サービス概要

Cellecta 社のゲノムワイドなヒト/マウスプール型レンチウイルス sgRNA ライブラリはゲノムワイドな約19,000種類の遺伝子を標的とする約 80,000 種類の sgRNA が含まれています。 1 標的遺伝子に対して最大 8 種類の sgRNA が設計されています。本ライブラリは sgRNA ごとに異なるバーコード配列が発現カセットに挿入されているため、スクリーニング後に次世代シーケンス解析することでノックアウトされた標的遺伝子を特定可能です。
スクリーニング実験後の細胞をご送付いただき、次世代シーケンスを行う受託サービスもご用意しております。

プール型レンチウイルス sgRNAライブラリ実験概要（fig.1）

fig.1 プール型レンチウイルス sgRNA ライブラリ実験概要

sgRNAライブラリの特徴

各標的遺伝子に対して4～8種類のsgRNA
全てのライブラリを合わせるとほぼ全ての遺伝子をカバー（19,000以上）
Illumina HiSeqおよびGAIIx、NextSeqにより標的遺伝子を特定可能

詳細

各 sgRNA ライブラリの標的遺伝子リストは下記のリンクからダウンロードして下さい。

生物種	標的遺伝子数	sgRNA数	標的遺伝子リスト
ヒト	約19,000	約80,000
マウス	約21,000	約86,000

本ライブラリは下記ベクターからご選択いただけます。

sgRNA Library Vector	NGS Cassette	Sequence (.txt \| .gbk \| .dna*)
pRSG16-U6-sg-UbiC-TagRFP-2A-Puro		FASTA \| GenBank \| SnapGene
pRSG17-U6-sg-UbiC-TagGFP2-2A-Puro		FASTA \| GenBank \| SnapGene

＊ dnaフォーマットファイルを開くために SnapGene^® Viewerをダウンロードして下さい。

fig.2 pRSG16-U6-sg-UbiC-TagRFP-2A-Puro

fig.3 pRSG17-U6-sg-UbiC-TagGFP2-2A-Puro

本ライブラリは広く使用されている第二、または第三世代の VSV-G 偽型ウイルス粒子や、Cellecta 社の第二世代の psPAX2/pMD2.G packaging plasmid mix（Ready-to-use Packaging Plasmid Mix, 品番： CPCP-K2A, 250 μg）によりパッケージすることができます。（fig.2）（fig.3）

sgRNA ライブラリスクリーニングの次世代シーケンス解析受託サービス

本サービスは、CLT 社ライブラリを使用して調製した各サンプルの凍結ペレット（細胞・組織）または gDNA (50 µg/sample, 1.0 -2.0 µg/µL) をご提供いただき、CLT 社にてDNA 抽出・増幅、次世代シークエンシングデータ取得・解析を行い、sgRNA 配列のリストをご提供するものです。

1.	お申込書類記載
2.	CLT 社へ細胞・組織ペレット（品番 CANA-SQ）、またはゲノムDNA（品番 CANA-SQD）の送付
3.	CLT社にて実験・解析作業
3.	各サンプルからゲノムDNAを抽出する（細胞、組織ペレットの場合）抽出したゲノムDNA のsgRNA配列を増幅後、次世代シーケンス解析ライブラリを調製する各サンプルの増幅されたsgRNA配列をシークエンス各 sgRNA 配列の相対存在量の算出報告書を作成
4.	コスモ・バイオより報告書（電子データ）を納品

ご注文に関して

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

参考価格・納期

◯ プラスミドライブラリ
品番	品名	包装	価格	納期
KOHGW-80Kv2-P	CRISPR Human Genome 80K v2 Knockout Library in UbiC-RFP-Puro (plasmid)	200 µg	お問い合わせ	3週間
KOHGW-UGP-80Kv2-P	CRISPR Human Genome 80K v2 Knockout Library in UbiC-GFP-Puro (plasmid)
KOMGW-86K-P	CRISPR Mouse Genome 86K Knockout Library in UbiC-RFP-Puro (plasmid)
KOMGW-UGP-86K-P	CRISPR Mouse Genome 86K Knockout Library in UbiC-GFP-Puro (plasmid)

営利団体のお客様と非営利団体のお客様で品番と価格が異なります。詳細はお問合せください。

◯ パッケージ済みウイルスフォーム
品番	品名	包装	価格	納期
KOHGW-80Kv2-V8	CRISPR Human Genome 80K v2 Knockout Library in UbiC-RFP-Puro (virus)	2 x 10⁸ TU	お問い合わせ	5週間
KOHGW-UGP-80Kv2-V8	CRISPR Human Genome 80K v2 Knockout Library in UbiC-GFP-Puro (virus)
KOMGW-86K-V8	CRISPR Mouse Genome 86K Knockout Library in UbiC-RFP-Puro (virus)
KOMGW-UGP-86K-V8	CRISPR Mouse Genome 86K Knockout Library in UbiC-GFP-Puro (virus)
KOHGW-80Kv2-V9	CRISPR Human Genome 80K v2 Knockout Library in UbiC-RFP-Puro (virus)	1 x 10⁹ TU
KOHGW-UGP-80Kv2-V9	CRISPR Human Genome 80K v2 Knockout Library in UbiC-GFP-Puro (virus)
KOMGW-86K-V9	CRISPR Mouse Genome 86K Knockout Library in UbiC-RFP-Puro (virus)
KOMGW-UGP-86K-V9	CRISPR Mouse Genome 86K Knockout Library in UbiC-GFP-Puro (virus)