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フィルジェン / フィルジェン ID: J00614

CNV（Copy Number Variation）アレイ受託解析
CytoScanTM HD/750K Array 受託解析サービス ID: J00614

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CNV解析、複製の起点やタイミングなどの染色体機能解析などを行います

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サービスについて

概要

CytoScanTM HD Arrayは、細胞遺伝学研究において、重要な染色体異常の検出と解析を、他のどの技術よりも高い信頼性で行うことができるCNV解析用アレイです。本アレイを用いて、微量ゲノムサンプルをお送り頂き、染色体のコピー数解析実験を行い、データ解析結果をご返却するサービスです。
CNV解析、複製の起点やタイミングなどの染色体機能解析などを行っています。
Thermo Fisher Scientific社製 専用解析ソフトウェア「Chromosome Analysis Suite（ChAS）」で、お客様自身の要件に基づくデータ解析とカスタムレポート作成をシンプルに行うことができます。

特長

  • アレイ
    CytoScanTM HD Arrayは、ヒトゲノム全体にわたる既知及び新規の染色体異常を検出できます。このアレイは、偏りのない全ゲノムカバー率、ゲノム全体を対象とする優れた性能（400kbを超えるコピー数変化に対する感度および特異性99％超）、最高密度のプローブ（75万個のSNPを含む260万個超のマーカー）で、遺伝子レベルのコピーニュートラルLOH、片親性イソダイソミー（UPD)、同祖的領域、低レベルのモザイク現象とサンプルの不均一性を検出することを特長としています。
  • 試薬
    完成され最適化されたCytoScanTM HD Reagent Kitは、細胞遺伝学コミュニティーのガイドラインを上回る性能を提供できる様にデザインされています。単純化され合理化されたアッセイプロトコールにより、一貫した高質な結果を得ることができます。
  • ソフトウェア（fig.1）
    Chromosome Analysis Suite（ChAS）ソフトウェアは、細胞遺伝学の専門家からの情報提供を受けて開発されたため、細胞遺伝学研究の解析とレポートに適合しています。合理化され、直感的に利用できる解析ワークフロー、多重グラフィックビュー、理解しやすいグラフィックインターフェースで表示される柔軟性の高い解析オプションなどを特長としています。簡単に使用できるChromosome Analysis Suite(ChAS) で、お客様独自の要件に基づくデータ解析とカスタムレポート作成をシンプルに行うことができます。

fig.1 CytoScanTM HD Chromosome Analysis Suite（ChAS）ソフトウェアイメージ

サービス内容

  • デザイン（アレイの仕様）

    コピー数マーカーの数
    コピー数マーカーの総数2,696,550
    非多型マーカーの数1,953,246
    SNPマーカーの数743,304
    遺伝子型を同定可能なSNPマーカー総数749,157
    ゲノムビルドhg19
    常染色体マーカー2,491,915
    偽常染色体マーカー4,624
    遺伝子内マーカー1,410,535
    遺伝子間マーカー1,286,015
    マーカー間隔の平均（塩基対）
    遺伝子内（以下のすべての遺伝子内）880
    ISCA constitutional genes384
    Cancer genes553
    OMIM Morbid genes659
    X Chromosome OMIM Morbid genes486
    RefSeq genes880
    遺伝子間（非遺伝子バックボーン）1,737
    全体（遺伝子及び非遺伝子バックボーン）1,148
    遺伝子カバー率（25マーカー/100kb）
    ISCA constitutional genes（340）100％
    Cancer genes（526）100％
    OMIM Morbid genes（2,640）98％
    X Chromosome OMIM Morbid genes（177）100％
    Refseq genes（36,121)96％
  • 受託解析サービスの流れ

    実験の流れ、納品データ等の詳細につきましては、「解析内容と実験の流れ」をご覧ください。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス名 サンプル数 価格（税抜） 納期
CytoScanTM HD 受託解析（10サンプル以上で受付） 10～19 お問い合わせ お問い合わせ
20～24 ￥142,000
CytoScanTM 750K 受託解析（10サンプル以上で受付） 10～19 お問い合わせ
20～24 ￥99,000

＊ 上記受託解析の価格には、アレイの価格も含んでいます。
＊ 上記価格には、ゲノムDNAの品質チェックの費用は含まれておりません。
　 品質チェックをご希望の場合は、「￥5,000（税抜）/サンプル」の追加料金が必要となります。
　 ゲノムDNA量が少ない場合は、アガロース電気泳動による品質チェックをご希望の場合でも、
　 チェックができませんので、予めご了承ください。

関連サイト

  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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