概要
菌種を識別するために広く用いられている16s/ITS/28（26）S rRNAの配列を解析するため、DNA抽出、PCR、シーケンス、アセンブル、BLASTまでの包括的なサービスを提供致します。
特徴
- 圧倒的なスピード： 菌株到着後 最短即日で結果を報告！遅くとも3日以内に納品いたします。（＊1）
- 幅広い対象： バクテリア、カビ、酵母に対応。
- 高品質なデータ保証： バクテリア16S解析では、27F-1492Rで増幅したPCR産物をテンプレートに、518Fおよび800Rでシーケンスを実施。
1,300bp以上の高精度な配列データを保証します。
＊1 納期に関するご注意
- 午前中にサンプルが到着した場合に限り、即日納品が可能です。
- 一度のご注文で20菌株以上の場合は、３営業日以上のお時間をいただく場合がございます。件数が多い場合は、事前にご相談いただけますとスムーズです。
マクロジェン・ジャパンが提供する系統樹は、あくまでも簡易的なものになります。
論文投稿に使用できるものでは御座いません。予めご了承ください。
プライマーセット
- 下図に示したプライマーセットのうち、ご希望のセットで解析いたします。また1セットだけでなく、2セットでの解析も可能です（別途料金が発生いたします）。
- 解析終了後、別のプライマーセットでの追加解析をご希望の場合はウェブオーダーより新規ご注文登録していただき、付記事項欄に「【初回ご注文番号】の追加解析分」とご記入ください。
- 下図に無い、カスタムプライマーでの解析をご希望の場合はご相談ください。
解析結果
解析が終了次第、以下のデータをダウンロードしていただくことができます。
- シーケンス結果（Raw data）
ab1, txt, pdf, phd, scf ファイルの5種類がございます。
- Contig配列
シーケンス結果から作成されたContigの情報です。
- Blast解析結果
Contig配列をクエリにしてBlast N解析をした結果です。
- Report
菌株ごとの解析結果について、まとめたレポートです。
データのダウンロードは結果通知メールのリンクまたはマイページでお願いします。
＊ 結果は1か月以内にダウンロードをお願いいたします。納品から1か月経過しますとデータを削除いたします。
＊ サンプルの保管期間は納品日より10日間です。保管期間を経過したサンプルはマクロジェン・ジャパンにて滅菌処理いたします。
＊ 当サービスではマクロジェン・ジャパンスタッフによる菌種同定は致しません。解析結果をご確認の上、お客様ご自身にてご判断ください。
菌株の準備
菌株は純粋培養されたシャーレまたはグリセロールストックでお送りください。
＊ 病原性を有する可能性のある菌株の場合、抽出はお受けできません。抽出済DNAの状態でお送りください。
シャーレでお送りいただく場合
・コロニーが目視で確認できる状態でお送りください。
・パラフィルムなどで封をお願いします。
・冷蔵便でお送りください。
グリセロールストックでお送りいただく場合
・遠心時にペレットが確認できる程度の菌量を、1mLほどお送りください。
・冷凍便でお送りください。
