C3チェックサービス ID: J00987

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カスタムアレイCGH解析による培養細胞の品質評価サービスです。

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サービスについて

特長

C3チェックサービス (aCGH for Cultured Cell Check Service ) は、培養工程（継代）における品質評価用アレイCGH法解析です。

再生医療用細胞をin vitroで継代培養し臨床応用を目指すとき、ゲノムの構造変化を知ることが重要です。DNAチップ研究所で開発したがん関連遺伝子領域に高密度にプローブを配置したカスタムアレイで、細胞培養時のゲノムコピー数変化を高解像度で検出します。細胞培養時におけるゲノムコピー数変化を高解像度でとらえることができます。

カスタムアレイCGH解析による培養細胞の品質評価サービスです。
培養工程（継代）におけるゲノムコピー数異常を高精度に検出します。
がん関連遺伝子領域の検出プローブ数を高密度に搭載しています。
再生医療等評価部会提示の腫瘍関連遺伝子（1,675）にも対応したプローブデザイン。
再現性のあるデータ解析をおこなうため、Dye-Swap検証を実施します。
アプリケーションノートは、こちらからご参照いただけます。
C3チェックサービス -再生医療分野での培養工程（継代）における品質評価用アレイCGH法解析-

概要

1	ゲノムDNAの抽出
2	サンプルのクオリティチェック
3	ゲノムDNAのラベル化
4	C3チェック実験・データ解析
5	検査レポートの作成

【作業概要】（fig.1）

DNAの品質確認（DNA Quality Check）を行います。
制限酵素を用いてゲノムDNAを断片化します。Random PrimerとExo-Klenow Fragmentを用いて断片化したゲノムDNAの相補鎖を合成します。コントロールとテストサンプルをそれぞれCy3、Cy5ラベル化をDye-Swapで行います。
ハイブリダイゼーションを行い洗浄後、スキャナーにより蛍光を検出をおこない蛍光強度を数値化してコピー数変化を生じたゲノム領域の検出を行います。

fig.1 作業概要

データ解析

1	生データ
2	データの整形
3	コピー数変化領域の検出

納品物

本サービスは測定結果レポートのみのご返却となります。(fig.2）（fig.3）
アレイ実験raw dataのご返却は行いません。

fig.2 解析結果報告書

fig.3 解析結果報告書

サンプルについて

細胞数	サンプル送付方法
1×10⁵以上	①培養液を除き、PBSなどで洗浄してください ②トリプシン処理を行い剥離させた細胞を回収します ③遠心後できるだけ上清を取り除き、ペレットのみの状態としてください

・お送りいただくサンプルはtest（継代培養後の細胞）とreference（培養初期の細胞）の2種類ご用意ください。（fig.4）
・サンプルは冷凍状態でご送付ください。
・サンプル量が実験の基準に満たない場合、サンプルの再送付をお願いすることがございます。

fig.4 サンプルについて

ご注文に関して

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目	価格（税抜）	納期
C3チェックサービス	お問い合わせ	サンプルのクオリティチェック（QC）通過後、1か月程度

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