日本ジェネティクス / 日本ジェネティクス ID: J01357

mRNA-Seq解析 ID: J01357

サービスについて

サービス仕様

  • シーケンシング:illumina NovaSeq 6000 / PE150
  • 納品データ:fastqファイル形式
  • 納品方法:データダウンロード(100Gb未満)/HDD納品(100Gb以上)

ライブラリー調製方法

mRNAをキャプチャー後に、NEBNext Ultra RNA LP Kitでライブラリーを調製します。

データ解析(オプション)

標準データ解析(リファレンスあり) 定量データ解析(リファレンスあり) 定量データ解析(リファレンスなし/De novo) クリーンデータ
クリーンデータ(CatNo. NV-CLEAN)をご依頼いただくと、以下の作業を行います。

1)オーバラップやアダプターダイマー等により、読み取ったアダプター配列の除去。
2)低質リード(Qphred ≦ 5の塩基数が全体リードの50%以上を占めるリード)の除去。
* Qphred=-10log10(e)塩基配列識別の正確性を示す単位。
3)塩基配列不明(N)が10%を超えるリードの除去。

*クリーンデータ後のデータは、fastqファイル形式となります。
*クリーンデータ前後のデータ両方を納品させていただきます。

サンプル要件

  • RNA量:200ng以上(total RNA)
    *血液サンプルの場合は400ng以上(total RNA)
  • 濃度:20ng/µL以上
  • 液量:10µL以上
    *血液サンプルの場合は20µL以上
  • RIN値:4.0 以上
    *血液サンプルの場合は5.8以上
  • 純度:OD260/280 = 2.0以上、OD260/230 = 2.0以上、RNAの分解、DNAのコンタミがないこと。

* 本サンプル要件に記載されているサンプル量は、最低量となります。
  記載のサンプル量の2倍の量が、推奨量となります。

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目 価格(税抜) 納期
mRNA-Seq解析 お問い合わせ サンプルQC合格後20営業日

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