ターゲット融合遺伝子解析。既知の融合遺伝子だけでなく、パートナー未知の融合遺伝子も同定可能です。
| パネル名 | 特徴 | 遺伝子数 | 
|---|---|---|
| Lung v2 | 肺癌に関連した融合遺伝子およびエキソンスキッピングをターゲット。 新規知見を踏まえてパネルデザインを更新。 | 16 (17*) | 
| Sarcoma v2 | 肉腫に関連した融合遺伝子をターゲット。対象遺伝子を大幅に増加。 | 61 (63*) | 
| Pan Solid Tumor v2 | 固形腫瘍と肉腫に関連した融合遺伝子をターゲット。 | 130 (137*) | 
| Heme v2 | 血液癌に関連した融合遺伝子をターゲット。 | 73 (87*) | 
| Myeloid | 骨髄性悪性腫瘍に関連した遺伝子をターゲット。 | 40 (84*) | 
| Acute Lymphoblastic Leukemia (ALL) | 急性リンパ性白血病に関連した遺伝子をターゲット。 | 44 (81*) | 
| Lymphoma | リンパ腫に関連した遺伝子をターゲット。 | 34 (125*) | 
* 発現レベル測定および点変異検出のためのターゲットも含む遺伝子数。
| パネル名 | 対象がん種 | ターゲット融合遺伝子(融合遺伝子数) | 
|---|---|---|
| RNA Fusion Lung Cancer Research Panel | 肺癌 | ALK、RET、ROS1、NTRK1を含む既知の融合遺伝子(61遺伝子) | 
| 検体数 | 8 | 
|---|---|
| 使用パネル | FusionPlex Lung v2 Panel | 
| 機種 | MiSeq | 
| 平均リード数 / 検体(*) | 約1Mペアリード | 
| リード長 | 150bp | 
| シーケンス方法 | Paired End / Multiplex | 
| バイオインフォマティクス解析 | 融合遺伝子の同定 | 納期 | 品質評価通過後、約2ヶ月 | 
* 得られるリード数は検体品質等の影響により、上記値を下回る場合がございます。
| サンプルの種類 | RNA量 | 濃度 | 溶液量 | 溶媒 | 
|---|---|---|---|---|
| 精製Total RNA | 1μg | 25ng/μL以上 | 20μL以上 | 10mM Tris-HCl (pH8.5)/Nuclease-free水 (EDTAを含むバッファーは不可) | 
* サンプルの定量はAgilent2100 バイオアナライザまたはAgilent2200 TapeStationを用いた方法を推奨しております。
* サンプルのバイオアナライザなどによる電気泳動図がお手元にある場合にはご提出をお願いします。
* 著しく分解が見られる検体の場合は、ライブラリー作製や解析結果に悪影響を及ぼす場合があります。
* 検体調整の際は、Invitae社の推奨に従い、DNase処理を実施しないで下さい。
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| サービス項目 | 価格(税抜) | 納期 | 
|---|---|---|
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