納期を大幅に短縮しました！
| 試料を送る | 抽出DNAを送る | 1stPCR産物を送る | |
|---|---|---|---|
| 価格（税抜） | ￥120,000/8サンプル | ￥96,000/8サンプル | ￥72,000/8サンプル |
| 納期 | 20営業日（＊1） | 15営業日（＊1） | 12営業日（＊1） |
| 作業内容 | DNA抽出～データ解析 | DNAの濃度測定～データ解析 | 1stPCR産物の精製～データ解析 |
| ご提供サンプルと送付方法 | 試料（＊2）：生物技研社提供のチューブの半分程度 | 抽出DNA：濃度0.5ng/μL以上、液量20μL以上 ＊濃度は、蛍光法を用いた2本鎖DNAの定量結果を基準としています。 260nmの吸光度ベースで定量されている場合、上記より高めの濃度（5ng/ul以上）が望ましいです。 |
1stPCR産物（精製前）：液量15μL以上 |
 必ず生物技研社提供の粉砕用1.5mLチューブをご使用ください。試料の種類（土壌、糞便など）と数をお知らせください。送料は生物技研社負担でお送りします。＜量の目安＞ 湿土壌：200～500mg程度 マウス糞便：米粒大2～3粒 |
濃度を0.5ng/μLに調製していただく必要はありません。また、基準濃度未満でも、受け入れています。 | アダプター配列付きのプライマーを生物技研社からご提供します（￥1,500（税抜）＊送料込）。ご希望の遺伝子領域をお知らせください。 = 1stPCR産物（未精製）の濃度測定は不要です。できれば電気泳動を行い、目的の増幅産物が得られていることをご確認ください。 |
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| 冷凍便で送付ください。 | 冷蔵便 or 冷凍便で送付ください（保存時と同じ温度帯がベストです）。 サンプル数が多いとき（目安：16サンプル以上）は8連チューブやプレートで送付ください。 |
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| シーケンシング条件 | illumina社MiSeqを用いて、2×300 bpの条件でシーケンシングを行います（他のお客様と相乗り）。 | ||
| データ量 | 1サンプルあたり3～5万リードペア程度 | ||
| 納品物 | ダウンロード形式での納品となります。 圧縮後のデータ量が2GBを超える場合は記録媒体での納品に変更させていただきます（目安は96サンプル） ・報告書 ・シーケンス生データ（fastq形式） ・系統解析結果 ・DDBJのデータベース登録に必要なデータ 納品データのサンプル ヒトの腸内細菌叢（解析領域は16SrRNAのV3/V4領域）の解析結果です。多様性解析（オプション）のデータも含まれています。 |
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＊1 納期は初回のPCRで良好な増幅が確認された場合です。再調製が必要な場合は追加日数をいただきます。2プレート（192サンプル）までは本納期で対応します。
＊2 生物技研社からご提供させていただく専用チューブに入れて発送いただきます。サンプルの形状等により生物技研社で追加の作業が必要と判断した場合は別途料金をいただきます。また、サンプルの内容（例えば感染性の有無）によりお断りする場合がございます。
DNA抽出は、対象生物やサンプルの状況によって抽出方法を最適化する必要がございます。より良いデータを得るための非常に重要なステップであると位置づけております。この観点から生物技研社におけるDNA抽出ノウハウに乏しいサンプルについてはお断りさせていただく場合がございます。
| 群間比較解析 ＊ 16S / 真菌ITS/ 18Sのみ対応 |
LEfSEを使って比較する群間の違いと相関を示す微生物群の抽出やある現象の原因微生物の探索を行います。 ★群間比較解析の納品データのサンプルをご用意しています。ダウンロードはこちら。 |
|---|---|
| 多様性解析 | レアファクション解析（chao1やshannonなど）と主座標分析（PCoA）の結果を提供いたします。サンプルのグループ分けをご指示いただくことで、グループ単位での比較が可能です。 ★ブラウザ上でデモデータをご覧いただけます。（主座標分析・レアファクションカーブ） |
| 多様性解析の統計解析 ＊ 多様性解析を行う必要があります |
ベータ多様性はPERMANOVAで検定し、アルファ多様性はKruskal-Wallisで検定します。 主成分分析(PCA)の結果とその結果に信頼楕円(95%)を加えた以下の図も納品します。  |
| 機能予測解析 ＊細菌16Sのみ対応 |
PICRUSt2を使って予測メタゲノム解析を行います。 ★機能予測解析＋統計解析の納品データのサンプルをご用意しています。ダウンロードはこちら |
| 機能予測解析の統計解析 ＊細菌16Sのみ対応 ＊ 機能予測解析を行う必要があります |
機能予測解析の結果から比較するグループ間で統計的に優位な差がみられるかを検定します。 ★機能予測解析＋統計解析の納品データのサンプルをご用意しています。ダウンロードはこちら。 |
| コピー数の取得 | リアルタイムPCR解析を行い、サンプル中の対象遺伝子のコピー数を測定します。アンプリコンシーケンス解析の結果を相対値から絶対値に変換したデータをお返しします。 |
| ネットワーク解析 | SpiecEasi (MB法) を使用して、ネットワーク解析を行います。 ★ネットワーク解析の納品データのサンプルをご用意しています。ダウンロードはこちら。 |
| 生息環境の推測 ＊細菌16Sのみ対応 |
16S rRNA遺伝子配列と微生物の生息環境を網羅的に結びつけるデータベース「ProkAtlas」を用いて、生息環境を推測します。 |
| サンプル数 | 試料を送る |
抽出DNAを送る |
1stPCR産物（精製前）を送る |
|---|---|---|---|
| 1 | ￥20,000(@￥20,000) | ￥15,000(@￥15,000) | ￥15,000(@￥15,000)（＊1） |
| 8 | ￥120,000(@￥15,000) | ￥96,000(@￥12,000) | ￥72,000(@￥9,000)（＊1） |
| 16 | ￥240,000(@￥15,000) | ￥192,000(@￥12,000) | ￥144,000(@￥9,000)（＊1） |
| 24 | ￥360,000(@￥15,000) | ￥288,000(@￥12,000) | ￥216,000(@￥9,000)（＊1） |
| 32 | ￥480,000(@￥15,000) | ￥384,000(@￥12,000) | ￥288,000(@￥9,000)（＊1） |
| 40 | ￥540,000(@￥13,500) | ￥420,000(@￥10,500) | ￥360,000(@￥9,000)（＊1） |
| 48 | ￥576,000(@￥12,000) | ￥432,000(@￥9,000) | ￥384,000(@￥8,000)（＊1） |
| 56 | ￥616,000(@￥11,000) | ￥448,000(@￥8,000) | ￥392,000(@￥7,000)（＊1） |
| 64 | ￥672,000(@￥10,500) | ￥480,000(@￥7,500) | ￥416,000(@￥6,500)（＊1） |
| 72 | ￥720,000(@￥10,000) | ￥504,000(@￥7,000) | ￥432,000(@￥6,000)（＊1） |
| 73～ | @￥10,000 | @￥7,000 | @￥6,000（＊1） |
＊1 1stPCR用のプライマー送付料金（￥1,500/依頼（税抜））が別途かかります。
サンプル数が8の倍数でないときも、上記1サンプルあたりの単価で対応します。
例）試料を18サンプル送る場合
16サンプルの場合の単価は@￥15,000ですので、￥15,000×18サンプル=￥270,000（税抜）となります。
| サンプル数 | 2ndPCR産物（精製後・混合不要）を送る（＊2） |
|---|---|
| 1～32 | 受け入れ可能ですが、価格は「1stPCR産物を送る」と同じです。 |
| 33～96 | パッケージではなく、下記項目を足し合わせた価格になります。 ・シーケンシング解析 ￥300,000/式 ・データ解析 ￥500/サンプル ・プライマー送付 ￥10,000/回 例）40サンプル・データ解析ありの場合：300,000+500×40+10,000=￥330,000 ◆シーケンシング解析の条件 MiSeq 2×300 bpの条件で、1ラン全体の20%量をアプライします。 ◆データ量 トータル300～400万リードペア程度です。 ◆納期 12営業日（但し、他のお客様とのインデックスの重複がある場合、5営業日程度追加になります） |
＊2 送付するライブラリーの濃度と液量は、10ng/μL以上、20μL以上でお願いします。精製済のライブラリーをプレート（または8連チューブ）に入れて冷蔵便 or 冷凍便で送付してください。
| 項目 | 価格 |
|---|---|
| 液体サンプルのフィルターろ過 | ￥4,000/サンプル |
| PCR阻害物質の除去 | ￥10,000/8サンプル |
| 1stPCR 4反復 | ￥16,000/8サンプル |
| ライブラリーのビーズ精製（＊4） | ￥5,000/8サンプル |
| ブロッキング | こちらをご覧ください |
| 残サンプルの返却 ＊送料込 | ￥1,500/回 |
| QIIME1に変更 | ￥0 |
| EzBioCloud 16S database使用（詳しくはこちら） | ￥10,000/解析 |
| 群間比較解析（細菌16S /真菌 ITS / 18Sのみ可能） | ￥30,000/解析 ＊ 比較パターンが複数ある場合は、追加1パターンごと￥10,000 |
| 多様性解析 | ￥10,000/解析（＊5） |
| ┗多様性解析の統計解析（多様性解析のオプション） | ￥20,000/解析 |
| 機能予測解析（細菌16Sのみ可能） | ￥30,000/解析（＊5） |
| ┗ 機能予測解析の統計解析（細菌16Sのみ可能/機能予測解析のオプション） | ￥30,000/解析 ＊ 比較パターンが複数ある場合は、追加1パターンごと￥10,000 |
| 機能予測解析と群間比較解析のセット割引 | 3割引 |
| コピー数の取得（＊5） ＊ 細菌・真菌・真核生物のみ可能 |
＜リアルタイムPCR解析を1反復実施する場合＞ リアルタイムPCR解析 ￥5,000/サンプル 検量線作成 ￥20,000（80サンプルごと） |
＜リアルタイムPCR解析を4反復実施する場合＞ リアルタイムPCR解析 ￥8,000/サンプル 検量線作成 ￥20,000（20サンプルごと） |
| ネットワーク解析 | ￥50,000/解析 |
| 生息環境の推測（細菌16Sのみ可能） | ￥20,000/解析 |
＊4 送付いただいたライブラリーが精製不足の場合、生物技研社で再精製を行います。
＊5 リアルタイムPCR解析と検量線作成の両方が必要です。また、アンプリコンシーケンス解析と同時にご注文いただいた際の価格です。データ解析のみでご依頼の場合は、別途QIIME解析の費用がサンプル数に応じて必要となります。
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