細胞にそれぞれ異なるバーコードを付与することで、細胞個々のmRNA遺伝子発現を調べることができます。
細胞凍結 | 細胞分散した後、40μmのフィルターを通しセルバンカー等の凍結溶液で凍結保存してください。凍結融解後に以下の条件を満たすことを事前にご確認ください。 ・細胞数100万細胞以上 ・生存率80%以上 ・細胞サイズは直径30μm以下 |
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細胞溶解・セルカウント | 細胞受領後、セルカウンターによる細胞数・生存率測定 |
シングルセル単離 | オイルと水のドロップレットにより細胞を1つ1つに単離 細胞1つにつき1種類のバーコード配列がドロップレットに含まれる |
ライブラリー作製 | cDNA合成・PCR増幅 |
シーケンス | 5,000細胞以上解析・リード数5,000/細胞以上(レパトア)、リード数3万/細胞以上を基準にしてシーケンス |
データ解析 | Cell RangerでFastq解析 ・Estimated Number of Cells ・Mean Reads per Cell ・Median Genes per Cell ・Reads Mapped Confidently to Genome (%) ・Reads Mapped Confidently to Intergenic Regions ・Fraction Antibody Reads (%) ・Reads Mapped Confidently to Intronic Regions (%) ・Reads Mapped Confidently to Exonic Regions (%) ・Reads Mapped Confidently to Transcriptome (%) ・Reads Mapped Antisense to Gene (%) |
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受託内容 | 価格(税抜) | おおよその納期 |
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10x Chromium Single Cell 3’RNA-seq(実験+シーケンス+解析) | ¥880,000 | 6週間 |
10x Chromium Single Cell Multiome ATAC + Gene Expression(実験+シーケンス+解析) |
¥1,450,000 | 8週間 |
死細胞除去オプション | ¥50,000 | お問い合わせ |
Totalseq抗体オプション2サンプル (実験+シーケンス+解析) |
¥80,000 | お問い合わせ |
核抽出方法最適化(細胞/組織) | 細胞:¥60,000 組織:¥120,000 |
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