ロングリードRNA-Seq解析（Iso-Seq） ID: J01746

印刷

ロングリードシーケンサーによる網羅的な全長アイソフォームの検出

カテゴリ

サービスについて

特長

ロングリードシーケンサーによるRNA-Seq解析
新規アイソフォームの配列取得、アイソフォームごとの発現解析が可能

概要

ロングリードシーケンサーPacBio Sequel II（パシフィックバイオサイエンス社）を用いて、遺伝子配列の取得を行います。ショートリードのシーケンスでは難しかったアイソフォームの配列決定、アイソフォームごとの遺伝子発現解析にご利用いただけます。

サービス内容

total RNAまたは組織・細胞等のサンプルを提供いただき、ライブラリー作製後、PacBio Sequel IIを用いてシーケンス解析を行います。得られたシーケンスデータを参照配列に対してマッピングすることで、アイソフォームごとの発現量解析や、新規アイソフォームの検出を行います。

作業の流れ（fig.1）

fig.1 作業の流れ

【オプションサービス】
細胞・組織からのRNA調製

納品物

作業報告書
シーケンスデータ一式
解析データ一式（マッピング結果ファイル、発現情報・アノテーション結果ファイル）（fig.2）（fig.3）

fig.2 納品データ例（マッピング結果例）

fig.3 納品データ例（アノテーション結果例）

受入サンプル

total RNAなど
以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。

	サンプル量	濃度	液量（目安）	純度
	サンプル量	濃度	液量（目安）	OD₂₆₀/OD₂₈₀	OD₂₆₀/OD₂₃₀
total RNA（＊1）	1μg以上	100ng/μL以上	10μL以上	1.6以上
組織・細胞（オプション）	お問い合わせ（＊2）

＊1 polyA＋ RNAが無い原核生物の解析は別途ご相談ください。
＊2 送付サンプルの採取方法によっては良質なRNAが抽出できない場合がございます。
・RNAサンプルはRNase free水に溶解してください。
・電気泳動にてrRNAの明瞭なバンドが検出され、分解していないことをあらかじめご確認ください。
・DNase処理を実施してください。
・上記基準に満たない場合は別途お問い合わせください。
・ご希望の作業に応じて、以下の点にご注意の上、解析サンプルを調製してください。
　 - ご送付いただいたRNAサンプルはアジレント2200 TapeStationなどを用いて検定を行います。
　　この時点で量・純度が次の作業に十分でない場合はご連絡し、対応方法についてご相談いたします。
　 - お客様よりご提供いただいたサンプル・情報および納品物の複製物は、別途期限を定めている場合を除き、
　　業務終了後3ヶ月を経過すると順次廃棄いたします。ご了承ください。

ご注文に関して

お問い合わせフォームよりお問い合わせください。

参考価格・納期

サービス項目	価格（税抜）	納期
ロングリードRNA-Seq解析（Iso-Seq）	お問い合わせ	お問い合わせ

受託オンラインCommissioned Research Online株式会社薬研社 株式会社薬研社