タカラバイオ / タカラバイオ ID: J01836

空間トランスクリプトーム解析（Spatial Transcriptomics） ID: J01836

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組織中の形態学的位置情報とリンクした遺伝子発現データを取得します。

カテゴリ

サービスについて

特長

Visium CytAssist Spatial Gene Expression for FFPE（10x Genomics社）を用いた解析
Visium CytAssist（10x Genomics社）を用いることでFFPEからのライブラリー調製が最適化され、より精度の高いデータが取得可能！
FFPEブロック送付で、スライド切片作製から実施
組織中の形態学的位置情報と紐づいた遺伝子発現データの取得が可能。腫瘍微小環境、細胞型、細胞マーカーなどの空間的構成の解析に！
ヒトまたはマウスに対応

fig.1 組織学的イメージ（H＆E染色画像）

fig.2 組織学的イメージ上に遺伝子発現結果を可視化

fig.3 遺伝子発現解析

サービス内容

FFPEブロックより切片スライドを作製し、HE染色を行い、画像を取得します。腫瘍マーキングも対応可能です。HE染色画像を確認いただき、解析領域を選択いただきます。シーケンスライブラリー調製、NovaSeqシーケンサーにてシーケンスを実施し、Space Rangerを用いて情報解析を実施します。解析結果はVisium空間的遺伝子発現解析の結果を可視化するLoupe Browser（10x Genomics社のウェブサイトから無償でダウンロード可能）で閲覧・追加解析いただけます。
＊スライド作製等の一部作業は病理会社へ委託します。
＊FFPEスライド（10x Genomics社推奨スライド使用）での受付も可能です。