中外テクノス / フナコシ ID: J01992

次世代シークエンスによる微生物群集構造（細菌叢）解析受託サービス ID: J01992

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微生物の種類と存在比率を高感度かつ網羅的に解析します。

カテゴリ

サービスについて

概要

中外テクノス株式会社では、次世代シークエンスによる微生物解析受託サービスを提供しています。
環境中に生息する微生物、腸内細菌、皮膚細菌などのDNA塩基配列を網羅的に調べることで、微生物の種類と存在比率を高感度かつ網羅的に解析します。

特長

信頼性の高いIllumina社MiSeqによるペアエンドシークエンスを採用。
1試料当たり3万リードを保証（5万リードを目安に取得）。
真正細菌、古細菌、藻類、真核生物などを網羅的に解析。
存在比率0.01～0.1％の微生物が検出可能。
解析後も考察・説明など、技術者が丁寧にフォローします。
菌叢分類（97％ OTU）

実施内容

お客様は試料（環境、口腔、皮膚、糞便試料）を送付するだけ、中外テクノス株式会社で前処理を実施し、解析後、菌叢分類リストや菌叢グラフ、解読した全配列を報告致します。（fig.1）

fig.1 実施内容

＊ DNA / RNA抽出が困難な場合は別途費用を頂戴する場合があります。
＊ヒト試料の場合は匿名化など、個人情報の保護をお願い致します。

報告内容

菌叢分類（門、網、目、科、属）リスト（fig.2）
分類群（門、網、目、科、属）の菌叢グラフ（fig.3）
解読した全配列、代表（OTU）全配列

fig.2 菌叢分類（門、網、目、科、属）リスト例

fig.3 分類群（門、網、目、科、属）の菌叢グラフ例

オプションデータ解析

多様性解析（レアファンクション、主座標分析、α多様性、β多様性）（fig.4）
BLAST解析（fig.5）
解析結果の考察、文献調査
　例）
　・活性汚泥、メタン発酵における運転条件、性能と主要な細菌の役割の関係性。
　・バイオフィルム、金属腐食の原因調査。カビ等の発生原因。

fig.4 多様性解析例

fig.5 BLAST解析例

分析対象生物

対象生物	解析遺伝子領域	分析例
原核生物（細菌、古細菌、ラン藻類）	16S rRNA	環境、環境技術、ヒトマイクロバイオーム
真核生物（酵母、カビ、藻類）	18S rRNA, ITS	環境、生活環境
魚類（＊1）	12S rRNA	環境調査（環境DNA）
哺乳類（＊2）	12S rRNA	環境調査（環境DNA）
鳥類（＊3）	12S rRNA	環境調査（環境DNA）

＊1 Miya, et al., doi: 10.1098/rsos.150088;
＊2 Ushio, et al., 2016. doi: 10.1111/1755-0998.12690;
＊3 Ushio, et al., 2018. doi: 10.1038/s41598-018-22817-5.

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参考価格・納期

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