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タカラバイオ / タカラバイオ ID: J02190

TCR/BCRレパトア解析 ID: J02190

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定量性に優れた低バイアスなレパトア解析

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サービスについて

特長

  • 低バイアスな遺伝子増幅法を用いた解析
  • ヒト・マウス・ラットの複数遺伝子のレパトア解析が可能
  • 検体ごとのクローン比較に加えて多様な情報解析が可能

サービス内容

Total RNAから低バイアスな遺伝子増幅法を用いてTCR、BCR遺伝⼦を増幅し、次世代シーケンサーを⽤いて塩基配列を取得します。得られた塩基配列をもとに多様性（レパトア）の解析を⾏います。

【解析対象遺伝子】
生物種 解析対象遺伝子
ヒト TCR：α, β, γ, δ
BCR：IgM, IgG, IgA, IgD, IgE, IgL, IgK
マウス TCR：α, β
BCR：IgM, IgG, IgA, IgD, IgE, IgL, IgK
ラット BCR：IgG, IgL, IgK　＊ラットはBCR解析のみ

【オプション】
  • 血液（全血）からのPBMC分離
  • 細胞ソーティング
  • 細胞・組織からのRNA調製 データ解析
  • 各種二次解析：類似性解析、主成分解析、ヒートマップ、Circosプロット、ロゴプロット　など

納品物

  • 作業報告書
  • シーケンスデータ（fastq）
  • 解析データ一式（fig.1）（fig.2）（fig.3）

fig.1 レパトア解析結果2Dグラフ

fig.2 ユニークリードランキング

fig.3 レパトア解析結果3Dグラフ
クラウド納品について
Boxによるクラウド納品を行います。共同研究者様とのデータの共有を簡単に行っていただけます。

＊ クラウド納品ご選択時の注意事項
  • シーケンスデータはサイズが大きいためダウンロードに時間を要する場合がございます。 事前に回線速度を測定し、ご確認の上、ご依頼ください。
    推奨回線速度計測サイトはこちらから
  • 回線速度が110 Mbpsの場合：500 GByteのダウンロードに10時間、50 Mbpsの場合：23時間が目安です。
  • シーケンスデータサイズの目安は以下となります。
    レパトアシーケンス 1遺伝子（シーケンスデータ量 20万～40万リード／検体）：約0.2 GByte／検体
  • 150 GByteを超える大量のデータをダウンロードする際にはBox Drive（デスクトップ用アプリ）をインストールしてご利用ください。
  • ご依頼内容によっては対応が難しい場合がございます。その場合は、メディア納品（HDD等）への変更をご案内します。
  • 事前のテストをご希望の場合はご連絡ください。

受入検体

以下の点にご注意の上、解析検体を調製してください。
検体量 濃度 純度
OD260/OD280 OD260/OD230
total RNA
（PBMC／T細胞／B細胞由来）		 500ng以上 50ng/μL以上 1.6以上
total RNA
（全血・組織由来）		 5μg以上 150ng/μL以上 1.6以上
組織 100mg以上 ―
血液 全血 3mL以上 ―
単離細胞検体
（PBMC、培養細胞、ソート細胞）		 1×106細胞以上 ―

＊ 解析に用いる検体量によってクロノタイプの検出数が変わります。ご送付いただいた検体量にあわせて、解析に用いる検体量を調整いたします。
＊ 末梢血、組織等にてご依頼の場合は、別途RNA抽出費用を申し受けます。
＊ Total RNAでご送付いただく場合の純度に関して、RIN値情報をお持ちの場合はご提供ください。（RIN 7以上を推奨）
＊ 組織は採取後速やかに－80℃で保存し、十分な量のドライアイスを同梱してタカラバイオ社へご送付ください。
＊ PBMC分離を希望する血液検体は、採血後48時間以内にタカラバイオ社到着となるよう室温でご送付ください。
＊ 単離細胞検体は、細胞凍結保存液を添加して凍結したものをご送付ください。

検体送付容器について
  • RNA検体は1.5mLチューブでご送付ください。0.5mLチューブ、PCRチューブ、8連チューブでの提供はご遠慮ください。
    24検体以上の場合は、96 well plateでご送付ください。プレートで送付いただけない場合は、納期が延びる場合がございます。
    プレートはタカラバイオ社より提供可能（無償）です。ご希望の方はお問い合わせください。
＜推奨プレートおよびシール＞
  • Eppendorf twin.tec full-skirted 96-well PCR plates（Eppendorf社, No. EP-0030128.648）
  • タイタースティックHCフィルム（WATSON社, No. 547-KTS-HC）

ご注文に関して

お問い合わせフォーム よりお問い合わせください。

製品カタログ・リーフレット
TCR/BCRレパトア解析受託サービス

参考価格・納期

サービス項目 価格（税抜） 納期
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  • ※価格及び、サービスの仕様・内容などにつきまして、予告なしに変更されることがあります。
  • ※表示している参考価格は消費税等は含まれておりません。
  • ※受託サービスは、すべて研究目的として作業を行います。その他の目的（医療品・食品の製造・品質管理や医療診断など）には使用しないで下さい。
  • ※納期は参考納期です。諸事情により、前後する場合がございます。納期の詳細については個別にお問い合わせください。
  • ※会社名・サービス名などは、各社の商標・登録商標です。
  • ※納品物によっては、その構成物（例えば、ベクター、蛍光色素など）の使用に制限がある場合があります。
  • ※ヒト臨床サンプルの場合はインフォームドコンセントを得ていることをご確認ください。 ヒト由来のサンプルの場合、ご所属の組織の倫理委員会などで承認が得られたものが受領されます。
  • ※人間への感染性が疑われるサンプルに関しては、お受けできない可能性がございます。
  • ※サンプルの保管および返却を行っていない場合があります。お客様より提供いただいたサンプルおよび解析データ等は、業務終了後、廃棄される場合がございます。

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